تشرف المؤسسة الدينية التابعة للمجلس الديني على الأعمال القائمة من قبل أهالي الرقة وأهل الفضل والإحسان في إعمار المساجد المدمرة ضمن مدينة الرقة وريفها، حيث كان هناك ما يقارب الـ 80 مسجداً مدمراً (60 بشكل كلي _ 20 بشكل جزئي)، حيث تم إنهاء الأعمال الترميمية لأكثر من 40 مسجداً، ويتم العمل حالياً على بناء 20 مسجد في المدينة، ومن ضمنها المسجد الكبير الذي يم تقديم الدعم له من قبل مجلس الرقة المدني.