تعمل مشفى الأطفال التخصصي على تقديم كافة الخدمات الطبية لأهالي مدينة الرقة وريفها وبشكل مجاني، حيث تضم المشفى عدة أقسام أساسية منها (قسم الإسعاف _ عيادات خارجية _ أشعة _ مخبر _ صيدلية _ عمليات جراحية _ عيادات أطفال _ قسم عزل)، بالإضافة لكادر طبي مختص.
حيث يعمل قسم الإسعاف على مدار الـ ٢٤ ساعة، وأيضاً قسم حواضن يضم ٣٠ حاضنة و١٠ غواصات للأطفال حديثي الولادة، والجدير بالذكر أن المشفى يستقبل ما يقارب ٣٥٠ حالة يومياً تقدم لهم الخدمات بالمجان.